新虎尾溪：麦寮乡、台西乡

        港口溪：满州乡

        屏东县

        大竹溪：大武乡、太麻里乡

        浊水溪：大城乡、云林县麦寮乡

        南势湖溪：枋山乡

        林边溪：林边乡、佳冬乡

        塔瓦溪：牡丹乡、台东县达仁乡

        郡大溪

        员林大排：鹿港镇、福兴乡

        陈有兰溪

        高屏溪：高雄市林园区、屏东县新园乡

        大武溪：大武乡

        枫港溪：枋山乡

        旧虎尾溪：台西乡、四湖乡

        东港溪：新园乡、东港镇

        乾溪：牡丹乡

        九棚溪：满州乡

        爱河：鼓山区、苓雅区

        荖溪

        浊口溪

        加走寮溪

        隘寮溪

        刣牛溪：恆春镇

        丹大溪

        四重溪：车城乡

        内寮溪：枋寮乡

        清水大排水沟（米粉寮溪）：清水区

        嘉义县

        菜寮溪

        将军溪：北门区、将军区

        南港溪

        牛挑湾溪：口湖乡

        七里溪：枋山乡

        八掌溪：布袋镇、台南市北门区

        万丈深坑溪：满州乡

        眉溪

        鹿野溪

        狮子溪：枋山乡

        竹坑溪：枋山乡、车城乡

        石牛溪：恆春镇

        鹿寮溪：满州乡

        洋子溪（洋仔厝溪）：鹿港镇

        津林溪（加津林溪）：大武乡

        浊水溪：彰化县大城乡、云林县麦寮乡

        龙溪：布袋镇

        前镇河：前镇区

        乌万溪（大鸟溪）：大武乡

        卑南溪：台东市

        乌溪：台中市龙井区、彰化县伸港乡

        知本溪：太麻里乡、台东市

        拉库音溪

        溪仔口溪：满州乡

        彰化县

        后堀溪

        太平溪：台东市

        卡社溪

        大石盘溪（石盘溪）：枋山乡

        南兴溪：大武乡

        清水溪

        塔瓦溪：屏东县牡丹乡、台东县达仁乡

        二林溪：芳苑乡

        十里溪：枋寮乡（地图未标示）

        安良港大排（南势溪）：清水区

        番雅沟：线西乡、鹿港镇

        率芒溪（士文溪）：枋寮乡、枋山乡

        乌溪：龙井区、彰化县伸港乡

        太麻里溪：太麻里乡

        前溪

        埤日溪：满州乡

        社口溪

        拉布拉溪：太麻里乡

        盐水溪：安南区、安平区

        八掌溪：嘉义县布袋镇、台南市北门区

        白水溪

        北港溪：云林县口湖乡、嘉义县东石乡

        重溪

        合欢溪

        枋山溪：枋山乡

        港子溪：满州乡

        高雄市

        阿公店溪：永安区、弥陀区

        北港溪：口湖乡、嘉义县东石乡

        高屏溪：林园区、屏东县新园乡

        大湖口溪

        宝来溪

        鹿耳门溪：安南区

        猫罗溪

        无水溪：满州乡

        汉宝溪：福兴乡、芳苑乡

        志乐溪

        二仁溪：南区、高雄市茄萣区

        安朔溪：达仁乡、大武乡

        美溪

        后劲溪：楠梓区

        朝庸溪：大武乡

        万大溪

        南仁鬱溪：满州乡

        南湖溪

        台南市

        旗山溪

        后港溪：芳苑乡

        典宝溪：梓官区、楠梓区

        曾文溪：七区、安南区

        文里溪（北太麻里溪）：太麻里乡

区

        七溪：七区

        利嘉溪：台东市

        二仁溪：台南市南区、高雄市茄萣区

        保力溪：车城乡

        大溪：牡丹乡

        鱼寮溪：大城乡

        社皆坑溪：车城乡

        水里溪

        三叠溪

        急水溪：北门区

        金崙溪：太麻里乡

        达仁溪：达仁乡

        台东县

        朴子溪：东石乡

        旧浊水溪：福兴乡

        旭海溪：牡丹乡

        云林县